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Musée paléoécologique de Cerin MARCHAMP
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Maison & Laboratoire de Louis Pasteur ARBOIS
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Ancienne fromagerie - Le Chalet du Coin d'aval FORT-DU-PLASNE
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Espace Charles Kieffer SELONCOURT
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Espace musée Sainte-Madeleine BESANCON
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Maison Victor Hugo BESANCON
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Maison du Patrimoine SAINT-AUBIN
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Ecomusée Les Outils d'Autrefois ARINTHOD
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Ecomusée les Vieux Clous NEUVILLE-SUR-AIN
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Musée du jouet MOIRANS-EN-MONTAGNE
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L'école d'autrefois CHATEAU-CHALON
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Musée de l'Espace des Mondes Polaires Paul-Émile Victor PREMANON
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Ferme-musée la Pastorale BONNEVAUX
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Ferme-musée du Montagnon FOURNETS-LUISANS
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Muséum – Citadelle de Besançon BESANCON
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Musée de la Vigne et du Vin du Jura ARBOIS
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Musée Archéologique CHAMPAGNOLE
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Calendrier gaulois et dieu de Coligny COLIGNY
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Musée de la Pipe et du Diamant SAINT-CLAUDE
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Musée de la Boissellerie BOIS-D'AMONT
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La Grande Saline de Salins-les-Bains SALINS-LES-BAINS
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Musée de la Tournerie LAVANS-LES-SAINT-CLAUDE
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Musée du Tacot CLERON
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L'Ébauche VILLERS-LE-LAC