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Musée du Ski et de la Tradition Rousselande
LES ROUSSES
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Musée des Lapidaires
LAMOURA
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Maison natale de Louis Pasteur
DOLE
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Musée des Beaux-Arts
DOLE
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Musée de la Boissellerie
BOIS-D'AMONT
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Musée de L'Aventure Peugeot
SOCHAUX
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Musée des Beaux-Arts
LONS-LE-SAUNIER
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Musée du jouet
MOIRANS-EN-MONTAGNE
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Musée de l'Espace des Mondes Polaires Paul-Émile Victor
PREMANON
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Musée de la Lunette
HAUTS DE BIENNE
Museum
Musée de l'Abbaye / donations Guy Bardone - René Genis
SAINT-CLAUDE
Museum
Ecomusée Les Outils d'Autrefois
ARINTHOD
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Apothicairerie de l'hôpital d'Arbois
ARBOIS
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Apothicairerie de Poligny
POLIGNY
Museum
Apothicairerie de Salins-les-Bains
SALINS-LES-BAINS
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Musée de la Tournerie
LAVANS-LES-SAINT-CLAUDE
Museum
Musée Relais du Cheval de Trait Comtois et de la Fôret
LEVIER
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Musée Courbet
ORNANS
Museum
Musée départemental des Sapeurs-Pompiers
GEX
Museum
Musée paléoécologique de Cerin
MARCHAMP
Museum
Musée archéologique de Briord
BRIORD
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Mini musée de la Fruitière d'Ordonnaz
ORDONNAZ
Museum
Isarnodurum - Musée archéologique
IZERNORE
Museum
Musée de la Résistance et de la Déportation de l'Ain
NANTUA